硬水には高濃度のカルシウム、マグネシウム、その他の無機塩が含まれており、加熱されて蒸発すると、水冷コンデンサーの熱交換器の表面にスケールの堆積物が形成されることがあります。時間の経過とともに、このスケールは冷却水とコンデンサーの金属表面の間の断熱バリアとして機能し、熱交換効率を損ないます。スケールが厚くなると、同じ冷却効果を達成するためにより多くのエネルギーが必要となり、システム効率の低下、運用コストの増加、およびシステムの摩耗の増加につながります。スケールの蓄積により凝縮器内の流量が低下し、圧力と温度が上昇する可能性があります。これらの影響に対処するために、多くの水冷コンデンサーは、カルシウムおよびマグネシウムイオンを除去する軟水器を採用したり、スケールの形成を抑制するスケール防止化学薬品を使用したりしています。

極端な pH レベルの水質（酸性またはアルカリ性が高すぎる）は、金属部品の腐食を引き起こす可能性があります。 水冷コンデンサー 。低い pH (酸性) 水は金属表面の酸化を引き起こし、錆びを引き起こしてコンデンサーの構造的完全性を弱める可能性がありますが、高い pH (アルカリ性) 水は金属表面を破壊するアルカリ腐食を引き起こす可能性があります。海水や工業用冷却水に多く含まれる塩化物の存在は、孔食を促進し、局所的な損傷を引き起こす可能性があります。腐食を防ぐには、酸性腐食とアルカリ性腐食の両方を防ぐのに理想的な、最適な pH 範囲 (通常は 7 ～ 8.5) を維持するように水を処理する必要があります。リン酸塩、亜鉛化合物、ケイ酸塩などの腐食防止剤は、水質が許容範囲内であることを確認するために、定期的な水質検査と併せて使用されるのが一般的です。

堆積物、泥、その他の粒子状物質を含む水源は、水冷コンデンサーの配管や熱交換器システム内での詰まりや閉塞を引き起こす可能性があります。これらの固体粒子は水の流れを妨げ、凝縮器から熱を運ぶ能力を低下させる可能性があります。流量の減少により凝縮器内の圧力が上昇し、全体の冷却効率が低下します。時間の経過とともに、堆積物の蓄積により内部コンポーネントの磨耗が発生する可能性があり、メンテナンスの必要性がさらに高まり、故障の可能性が高まります。これらの問題を軽減するために、通常、濾過システムまたはストレーナが水の入口点に設置され、大きな粒子が凝縮器に入る前に捕捉されます。これらのシステムは、内部コンポーネントに損傷を与えたり、性能を低下させたりする可能性のある砂、シルト、その他の浮遊固体を除去するように設計されています。

生物付着は、細菌、藻類、真菌などの微生物が凝縮器の熱交換面に蓄積すると発生します。これらの微生物は放っておくと熱伝達を著しく損なう断熱層として機能するバイオフィルムを形成する可能性があります。また、バイオフィルムは腐食や詰まりを促進し、システムの効率をさらに低下させます。生物付着は、高レベルの有機物質を含む地表水 (川、湖、または海水) を使用するシステムでより一般的です。藻類の成長は、水の流れを妨げ、システムが熱伝達効率の低下を補うため消費電力の増加につながる可能性があるため、特に問題となります。生物付着に対抗するために、水処理システムには多くの場合、微生物がバイオフィルムを形成する前に微生物を殺す化学殺生物剤 (塩素、臭素、または銅ベースの化合物など) が含まれています。紫外線 (UV) 光処理は、微生物の増殖を防ぐもう 1 つの環境に優しいオプションです。